凯发k8国际 > 产品与服务 > 多组学服务

BSAS（重亚硫酸盐扩增子测序法）

产品简介

根据特异基因区域或CpG岛的序列设计实验，Bisulfite PCR扩增之后结合第二代高通量测序，能避免载体克隆测序的大量工作量和高昂成本，大大提高DNA甲基化分辨率的同时完成多个样本多个候选区域的DNA甲基化分析。

技术路线

技术特点

1. 使用目标区域的PCR富集和转座体介导的文库构建；

2. 可从低（1 ng）样品输入中快速生成测序文库；

3. 可以对特异基因组区域内的甲基化胞嘧啶进行精准的绝对定量；

4. 适用于高通量甲基化测序以后，特定基因或者区域的甲基化验证。

研究思路参考

经典案例


研究目的：利用启动子甲基化检测MDGA2在胃癌中优先被甲基化的生物学效应和预后意义

样本信息：原发性胃癌组织和胃癌细胞

测序策略：BSAS

结论：MDGA2在胃癌细胞和原发性胃癌中由于启动子高甲基化而普遍被沉默。MDGA2在体外通过引起G1-S细胞周期停滞和诱导细胞凋亡来明显抑制细胞增殖，并在皮下和正位异种移植小鼠模型中抑制异种移植肿瘤的生长。MDGA2的抗肿瘤作用是通过直接稳定DNA甲基转移酶1相关蛋白1（DMAP1）来介导的，DMAP1在胃癌中起到抑制肿瘤的作用。MDGA2是胃癌发生过程中一个关键的肿瘤抑制因子，其高甲基化是胃癌患者的一个独立预后因素。

结果展示

分析流程




标准品制备的标准曲线



不同样本目标片段不同位点甲基化比例

根据目标片段的各位点甲基化片段信息，获得相应甲基化比例。





样本分组分析结果


送样建议

样本量


亚硫酸氢盐扩增子测序（BSAS）

gDNA

基因组DNA用TE溶解，总量≥2μg，纯度OD260/280在1.8-2.0之间，浓度≥50ng/μl（Qubit的检测浓度，不是NanoDrop的检测浓度）

DNA完整无降解，无RNA、蛋白质、多糖等污染

注意：若样本来源为非人类的其他物种，请特别指明

细胞样本

≥1x106个细胞

收获培养的细胞后，离心去除培养液，PBS洗2次，液氮速冻，-80℃保存，干冰运输

组织样本

冻存组织≥100mg，PBS清洗血渍毛发等，吸干，液氮速冻，-80℃保存，干冰运输

石蜡包埋组织

每个样本需要≥10片石蜡切片，每片≥5μm，同时提供对应的H&E染色片子

低温保存，4℃运输

血液样本

≥2ml，EDTA抗凝（不能用肝素）、-80℃保存，干冰运输

血清/血浆

≥4ml，EDTA抗凝（不能用肝素），-80℃保存，干冰运输

外周血cell-free

游离DNA

推荐2种保存运输方法，任选其一

1、使用Streck cell-free血浆游离DNA采血管进行采血，采血总量≥10ml，具体使用方法见Streck 说明书

2、血浆或者血清总量≥6ml，直接保存于-80℃，干冰运输

点击进行购买咨询

购买咨询

欢迎进行购买咨询

购买咨询